A acção da Fundação no campo da Ciência desenvolve-se em três grandes linhas de intervenção: o estímulo à criatividade e à investigação científica, a promoção da divulgação científica de qualidade e o fortalecimento da interacção entre a ciência e a sociedade.
São vários os programas, prémios e iniciativas conduzidos pelo Serviço de Ciência para a consecução destes objectivos, muitos dos quais em cooperação com instituições de âmbito público e privado (universidades, laboratórios de investigação, associações científicas e museus).
O Instituto Gulbenkian de Ciência representa uma intervenção directa da Fundação na área da Ciência, constituindo um espaço activo de investigação, formação e serviços em biomedicina. Dispõe de um corpo de investigadores e técnicos próprios, funcionando num modelo de "host institution", abrindo-se à comunidade científica nacional e internacional.
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